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Título: Geographic Population Structure Analysis of Worldwide Human Populations Infers their Biogeographical Origins
Autor: Elhaik, Eran
Tatarinova, Tatiana
Chebotarev, Dmitri
Piras, Ignazio S.
Calo, Carla Maria
De Montis, Antonella
Atzori, Manuela
Marini, Monica
Tofanelli, Sergio
Francalacci, Paolo
Pagani, Luca
Tyler-Smith, Chris
Xue, Yali
Schurr, Theodore G.
Gaieski, Jill B.
Melendez, Carlalynne
Vilar, Miguel G.
Owings, Amanda C.
Gómez, Rocío
Fujita, Ricardo
Santos, Fabrício R.
Comas, David
Balanovsky, Oleg
Balanovska, Elena
Zalloua, Pierre
Soodyall, Himla
Pitchappan, Ramasamy
Ganesh Prasad, ArunKumar
Hammer, Michael
Matisoo-Smith, Lisa
Wells, R. Spencer
Temas: Genética de población
Pruebas genéticas
Variación genética
Fitogeografía
Características de la población
Biogeografía
Fecha de publicación: 29-abr-2014
Lugar de publicación: Nature Communications
Citación: Elhaik E., Tatarinova T., Chebotarev D., Piras IS., Calo CM., De Montis A., et al. Geographic population structure analysis of worldwide human populations infers their biogeographical origins. Nature Communications 2014; 5 (3513): 1-12.
Citación: Nature Communications;vol. 5, n. 3513
Resumen: The search for a method that utilizes biological information to predict humans’ place of origin has occupied scientists for millennia. Over the past four decades, scientists have employed genetic data in an effort to achieve this goal but with limited success. While biogeographical algorithms using next-generation sequencing data have achieved an accuracy of 700 km in Europe, they were inaccurate elsewhere. Here we describe the Geographic Population Structure (GPS) algorithm and demonstrate its accuracy with three data sets using 40,000–130,000 SNPs. GPS placed 83% of worldwide individuals in their country of origin. Applied to over 200 Sardinians villagers, GPS placed a quarter of them in their villages and most of the rest within 50km of their villages. GPS’s accuracy and power to infer the biogeography of worldwide individuals down to their country or, in some cases, village, of origin, underscores the promise of admixture-based methods for biogeography and has ramifications for genetic ancestry testing.
Identificador digital (URI): http://www.repositorioacademico.usmp.edu.pe/handle/usmp/1529
ISSN: 2041-1723 (Digital)
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